Ich kann nur immer wieder den Tipp geben: Nehmt Musik unter Creative Commons Lizenz. Die kann oft kostenfrei und unbedenklich in Filmprojekten verwendet werden. In manchen Fällen ist es ratsam, vorher Kontakt mit den Künstlern aufzunehmen, was aber nach persönlicher Erfahrung kein Problem ist.
http://de.creativecommons.org/was-ist-cc/
Ansonsten: Wenn der Clip als Werbevideo für eure Schule fungieren soll, ist die Frage, ob das direkt von der Schule gewünscht ist bzw. in Auftrag gegeben. Dann würd ich mich einfach erkundigen, ob die Schule an sich irgendwelche Vereinbarungen mit der GEMA getroffen hat. Manche Bildungseinrichtungen machen sowas, vor allem solche, die auch irgendwas mit Medien zu tun haben. Da gibt es oft Vereinbarungen, dass die Nutzung von geschützter Musik ohne größere Probleme erlaubt ist. Kommt halt auf die Konditionen an.