Du legst die Sequenz auf jeden Fall in dem Format an, in welchem du die Endausgabe planst, also in deinem Fall dann die 24fps.
Jetzt bin ich aber nicht sicher, was passiert, wenn man einen 60fps-Clip in diese Timeline zieht und dann die Geschwindigkeit verändert. Sicherer wäre es auf jeden Fall, wenn du den 60fps-Clip als 24fps angibst ("Filmmaterial interpretieren"), dann ist der automatisch Zeitlupe.