Wenn sich in der Timeline mehrere Instanzen des selben Videos befinden, dann hat das keinerlei Auswirkungen auf den Festplattenspeicher. AE legt keine Kopien der Videos an, um Effekt darüber zulegen, von daher kannst du das Video sowohl einmal als auch mehrmals in der Timeline verwenden, ohne das darunter der Speicherplatz leidet. Genauso beim Rendern nachher, AE rendert genau das was man sieht, nicht mehr und nicht weniger, unabhängig davon, wie oft ein Video in der Timeline liegt.