Zu 1:
Animier das ganze in 3D mit einer Kamera (bringt auch den Effekt mit dem Himmel besser zur Geltung)
Dann animier die Kamera selbst und geh auf den Motionblur-button über der Zeitleiste (eine Kugel, die nach rechts oben fliegt)
und aktivier auch noch den motionblur schalter der jeweiligen Ebenen.
Zu 2:
Du solltest das Zeichen, das du in den Himmel (Tipp: in die wolken, wie bei batman, in den Sternen würdest du es nie sehen) werfen möchtest, bei Photoshop erstellen (am Besten mit einem leichten Lichtstrah, der zeigt, woher das Licht kommt)
Wie du das genau mit Photoshop machst, kannst du
hier erfahren.
Das ganze dann mit Alpha-kanal also als gif oder sonstiges abspeichern und dann das Bild einfach bei AE einfügen.
Um das ganze Flackern zu lassen, spiel einfach n bisschen mit der Deckkraft der Ebene (Taste T).
Dabei einfach innerhalb weniger frames von 100 auf 0 und wieder auf 100 oder so ähnlich.
Das ganze dann mit der Stoppuhr animieren und fertig.
Was ich dir nicht sagen kann, ist wie du das mit den Konturen der Wolken machst, da wolken ja nicht glatt sind und das Bild so ein bisschen verzehrt wäre.